Le aeronavi presenti nel gioco sono abbastaza variegate: se ne trovano di tante forme e misure differenti ma sono tutti velivoli relativamente high-tech.
L'aeronave principale del nostro party è la Strahl.
La maggior parte delle aeronavi prende il nome dalle tradizionali evocazioni di Final Fantasy come le navi da combattimento Alexander,Ifrit, Leviathan,Shiva, Odin e Bahamut.
La nave ammiraglia di Maquir Ondore è invece nota come Garland.
Alcuni dungeons del gioco sono l'interno delle navi.
Strahl
Aeronave progettata e costruita da YPA, maestro d'ascia della corporazione di Arcadia.
Ufficialmente chiamata YPA-G847 Test Combat Fighter, la produzione fu sospesa dopo il completamento di un un test su un modello trovato non soddisfacente dai clienti imperiali che reputarono troppo caro il progetto.
Scartato il progetto la nave fu presa e modificata da Balthier che la rese una nave totalmente diversa dall'originaria.
Ifrit
Prende il nome dalla famosa Guardian Force di FFVIII Ifrit.
Incrociatore appartenente all'ottava flotta dell'esercito imperiale Arcadiano. Guidò il contrattacco contro la Resistenza nel palazzo reale di Rabanastre.
Leviathan
Prende il nome dall'evocazione Leviathan apparsa in diversi Final Fantasy sottoforma di drago in grado di controllare il potere dell'acqua.
Corazzata e nave ammiraglia dell'ottavo reggimento dell'esercito Arcadiano. Creata per resistere a tutto, la Leviathan è stata l'acciarino della flotta principale dell'esercito imperiale.
Affondata dall'esplosione causata dal Dawn Shard.
Shiva
Incrociatore leggero dell'ottava flotta dell'esercito imperale Arcadiano, questa aeronave è stata battezzata con il nome di Shiva, evocazione presente in molti Final Fantasy.
Fu affondata in un esplosione prima di riuscire a fare porto a Rabanastre.
Alexander
Portaerei. Fu ammiraglia del dodicesimo reggimento comadato da Judge Zargabaath. Il nome è evidentemente preso dalla Guardian Force omonima di Final Fantasy VIII.
Bahamut
Fortezza volante appartenente alla divisione occidentale dell'esercito Arcadiano.
Bahamut è una fortezza mobile usata come base tattica sotto il controllo del comandate Lord Vayne. E' stata l'ultima aereonave disegnata dal Dr. Cid.
Questa nave è in grado di assorbire la nebbia per generare il massiccio quantitativo di energia necessario per far funzionare la fortezza. Anche Bahamut è una nota evocazione di molti Final Fantasy.
Garland
Portaerei. E' stata la nave ammiragia della coalizione anti imperialista capitanata da Marquis Ondore. E' stata costruita in segreto da Marquis durante i preparativi per la guerra contro l'impero Arcadiano. Si pensa che abbia le stesse capacità dell'Alexander.
Galuf Val
Incrociatore pesante della resistenza, il galuf val è una delle tante aeronavi distrutte durante la battaglia di Rabanastre. è stata distrutta da un attacco a sorpresa della Bahamut e dell'Alexander.
Remora
Questa è una piccola aeronave. Molto più piccola delle altre che prende il nome da un branco di piccoli pesci apparsi in FFV.
Valefor
Ha caratteristiche simili a quelle dell'eone di FFX infatti possiede e ali molto flessibili, proprio come quelle degli uccelli.